Perchè perde il progetto? Basta salvarlo in un un altro HDD. Ovviamente anche i media devono essere in altri HDD. Poi comunque Liquid si installa di regola in C: e si archiviano i files relativi al progetto in HDD diversi. Io faccio sempre così, e non ho mai perso niente.
Però non mi assumo responsbilità per chi non ha abbastanza esperienza per fare attenzione a non perdere nulla.