da quel che scrivi lasci intuire che hai impostata una finestra di lavoro in fullHD. Se fosse così hai già perso il 75% della risoluzione di ciuascun video
Esportando in fullHD non ne perderai altra.
Esportando in metà del fullHD (che non è uno standard) ne perderai ancora.
Per non perdere nulla della risoluzione originaria dovresti aprire una finestra in UHD e metterci dentro i due video, senza ridurli (ci entrano così come sono) ed esportare in UHD