Condivido quanto detto da @fearless
Purtroppo se hai difficoltà nel riconoscere effetti di pixellation,maschere e sfumate e fusioni tipo dodge credo superfluo dirti che aggiungervi pure tutta la macchinosità operativa di un software di animazione come after effect non può altro che complicarti la situazione.
Come ancora ben detto da @fearless meglio photoshop.(e volendo c'è poi che photoshop fornisce ambiente e strumenti per creare e gestire filmstreep e animazione)
E poi se avrai premura di operare affinchè tutti i passaggi siano su livelli separati e distinti e di salvarti una copia in pds.con il tempo quando avrai fatta buona pratica con photoshop potrai importare il pds in ae. e qui' ti risultera' il tutto sicuramente + semplice.
Ad es.. come e con cosa sostituire filtri,maschera e fusione utilizzati con quelli propi di ae(sicuramente più adatti alla videoriproduzione e videoanimazione)