Ciao,
nel link allegato parlano di High Sierra e non associano il problema ad un cambio di versione. Non c'è certezza che si tratti dello stesso problema, ma senz'altro può essere un utile riferimento anche per te.
Tu hai controllato se nelle clip originali, nello stesso punto, appare un anomalia?
Nel link la questione è sicuramente legata al processo di render. Non conosco l'ambiente mac però mi pare strano che i render file non vengano mostrati in timeline con il difetto. Salvo che le clip non vengano riprocessate da capo durante l'export e in tal caso i difetti potrebbero mostarsi su istanti diversi da quelli in timeline.
La soluzione proposta è da provare, però sono scettico che sia deterministica: forse i glitch si formano in punti diversi e non vengono notati.
Se in FCPX il render è affidato anche alla GPU si potrebbe pensare di escluderla per prova, oppure a vedere se sia il caso di aggiornare i suoi driver (n.b. ragiono come nel mondo PC e non vorrei dire castronerie)